Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SfnO70456 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SfnO70456 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SfnO70456 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SfnO70456 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SfnO70456 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms