Protein–RNA interactions for Protein: O55225

Otog, Otogelin, mousemouse

Predictions only

Length 2,910 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtogO55225 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
OtogO55225 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
OtogO55225 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
OtogO55225 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtogO55225 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtogO55225 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtogO55225 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtogO55225 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtogO55225 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtogO55225 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
OtogO55225 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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