Protein–RNA interactions for Protein: O55201

Supt5h, Transcription elongation factor SPT5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,082 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt5hO55201 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Supt5hO55201 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Supt5hO55201 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms