Protein–RNA interactions for Protein: O55144

Tlx3, T-cell leukemia homeobox protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlx3O55144 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tlx3O55144 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tlx3O55144 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tlx3O55144 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms