Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Eif6O55135 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms