Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
BckdkO55028 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
BckdkO55028 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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