Protein–RNA interactions for Protein: O55013

Trappc3, Trafficking protein particle complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3O55013 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Trappc3O55013 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Trappc3O55013 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms