Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc27a2O35488 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc27a2O35488 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms