Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Edil3O35474 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Edil3O35474 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
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