Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Prrt1O35449 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Prrt1O35449 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Prrt1O35449 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Prrt1O35449 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
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