Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rnf5O35445 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms