Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Dgcr6O35347 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms