Protein–RNA interactions for Protein: O35344

Kpna3, Importin subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna3O35344 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Kpna3O35344 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms