Protein–RNA interactions for Protein: O35226

Psmd4, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd4O35226 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Psmd4O35226 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Psmd4O35226 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms