Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Nedd9O35177 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
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Nedd9O35177 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Nedd9O35177 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Nedd9O35177 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
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