Protein–RNA interactions for Protein: O35137

Alx4, Homeobox protein aristaless-like 4, mousemouse

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Length 399 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alx4O35137 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Alx4O35137 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Alx4O35137 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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Alx4O35137 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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