Protein–RNA interactions for Protein: O09172

Gclm, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GclmO09172 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GclmO09172 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GclmO09172 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
GclmO09172 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GclmO09172 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
GclmO09172 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
GclmO09172 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
GclmO09172 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
GclmO09172 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
GclmO09172 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms