Protein–RNA interactions for Protein: O09005

Degs1, Sphingolipid delta(4)-desaturase DES1, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Degs1O09005 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Degs1O09005 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Degs1O09005 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Degs1O09005 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Degs1O09005 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Degs1O09005 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
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Degs1O09005 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Degs1O09005 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
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Degs1O09005 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Degs1O09005 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms