Protein–RNA interactions for Protein: O08584

Klf6, Krueppel-like factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf6O08584 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Klf6O08584 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Klf6O08584 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms