Protein–RNA interactions for Protein: G5E8J6

Hrc, Histidine rich calcium binding protein, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 738 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HrcG5E8J6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
HrcG5E8J6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
HrcG5E8J6 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms