Protein–RNA interactions for Protein: G3XA12

4933406M09Rik, RIKEN cDNA 4933406M09, mousemouse

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933406M09RikG3XA12 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
4933406M09RikG3XA12 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
4933406M09RikG3XA12 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms