Protein–RNA interactions for Protein: G3X9R7

Rnf148, RING finger protein 148, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf148G3X9R7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rnf148G3X9R7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.3 ms