Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pnmal2G3X9N3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pnmal2G3X9N3 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms