Protein–RNA interactions for Protein: G3X9M3

Hmgxb3, HMG box domain-containing 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgxb3G3X9M3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Hmgxb3G3X9M3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Hmgxb3G3X9M3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms