Protein–RNA interactions for Protein: G3UW56

Vmn2r85, MCG21565, mousemouse

Predictions only

Length 850 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r85G3UW56 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn2r85G3UW56 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Vmn2r85G3UW56 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms