Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ5

Ercc6, Excision repair cross-complementing rodent repair deficiency, complementation group 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6F8VPZ5 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm15201-201ENSMUST00000136472 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Ercc6F8VPZ5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ercc6F8VPZ5 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Ercc6F8VPZ5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms