Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Gm37083-201ENSMUST00000195784 711 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Farp1F8VPU2 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Clec4d-201ENSMUST00000032240 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Farp1F8VPU2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms