Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Gm8444F6XS56 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm8444F6XS56 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms