Protein–RNA interactions for Protein: F6X8D5

Gm42421, Predicted gene, 42421 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm42421F6X8D5 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Gm42421F6X8D5 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm42421F6X8D5 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms