Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Gm340F6RGI3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gm340F6RGI3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms