Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Lmod3E9QA62 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms