Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Cald1E9QA15 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Cald1E9QA15 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms