Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Pdzd7E9Q9W7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms