Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 H1fnt-201ENSMUST00000060855 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm27437-201ENSMUST00000183429 107 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Urb2E9Q7L1 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Urb2E9Q7L1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms