Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5Z5

Fancf, Fanconi anemia group F protein, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancfE9Q5Z5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
FancfE9Q5Z5 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
FancfE9Q5Z5 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms