Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0F0

Krt78, Keratin 78, mousemouse

Predictions only

Length 1,068 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt78E9Q0F0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Krt78E9Q0F0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Krt78E9Q0F0 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms