Protein–RNA interactions for Protein: E9Q043

Fndc1, Fibronectin type III domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,732 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc1E9Q043 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm22065-201ENSMUST00000103753 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm22066-201ENSMUST00000103761 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fndc1E9Q043 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Fndc1E9Q043 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms