Protein–RNA interactions for Protein: E9PZM7

Scaf11, SR-related CTD-associated factor 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scaf11E9PZM7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Scaf11E9PZM7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Scaf11E9PZM7 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms