Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Brd1E9PZ26 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Brd1E9PZ26 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms