Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF3

Gm5415, Predicted gene 5415, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5415E9PXF3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm5415E9PXF3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Gm5415E9PXF3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms