Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Ing4-201ENSMUST00000032480 1629 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trappc8E9PWG2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Trappc8E9PWG2 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms