Protein–RNA interactions for Protein: E1U8D0

Soga1, Protein SOGA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Soga1E1U8D0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Soga1E1U8D0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Soga1E1U8D0 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Soga1E1U8D0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms