Protein–RNA interactions for Protein: D3YZP9

Ccdc6, Coiled-coil domain-containing protein 6, mousemouse

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Length 469 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc6D3YZP9 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm42560-201ENSMUST00000201216 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Rassf8-202ENSMUST00000058538 1131 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc6D3YZP9 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Lamtor3-201ENSMUST00000168345 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc6D3YZP9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
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