Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rnf217D3YYI7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms