Protein–RNA interactions for Protein: D3YUK0

Gm3259, Predicted gene 3259, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3259D3YUK0 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Gm3259D3YUK0 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms