Protein–RNA interactions for Protein: C0LLJ0

Kpna7, Importin subunit alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kpna7C0LLJ0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Kpna7C0LLJ0 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Kpna7C0LLJ0 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms