Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PtprbB2RU80 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PtprbB2RU80 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms