Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Znf518aB2RRF6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Znf518aB2RRF6 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms