Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Otud4B2RRE7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Otud4B2RRE7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms