Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Brpf3B2KF05 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Brpf3B2KF05 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms